Ano ang pagkakaiba sa pagitan ng Sanger sequencing at next generation sequencing?
Ano ang pagkakaiba sa pagitan ng Sanger sequencing at next generation sequencing?

Video: Ano ang pagkakaiba sa pagitan ng Sanger sequencing at next generation sequencing?

Video: Ano ang pagkakaiba sa pagitan ng Sanger sequencing at next generation sequencing?
Video: Next-Generation Sequencing & Sanger Sequencing 2024, Nobyembre
Anonim

susunod - pagkakasunud-sunod ng henerasyon Ang mga teknolohiya ng (NGS) ay magkatulad. Ang kritikal pagkakaiba sa pagitan ng Sangersequencing at ang NGS ay pagkakasunud-sunod dami. Habang ang Sanger paraan lamang mga pagkakasunod-sunod isang solong DNA fragment ata oras, NGS ay napakalaking parallel, pagkakasunud-sunod milyon-milyong mga fragment nang sabay-sabay sa bawat pagtakbo.

Bukod, paano gumagana ang susunod na henerasyon na pagkakasunud-sunod?

Ang prinsipyo sa likod Pagsunud-sunod ng Susunod na Henerasyon (NGS) ay katulad ng kay Sanger pagkakasunud-sunod , na umaasa sa capillary electrophoresis. Ang genomic strand ay pira-piraso, at ang mga base sa bawat fragment ay nakikilala sa pamamagitan ng mga ibinubugang signal kapag ang mga fragment ay pinagdikit sa isang template strand.

Gayundin, bakit mas mahusay ang NGS kaysa kay Sanger? NGS ay makabuluhang mas mura, mas mabilis, nangangailangan ng makabuluhang mas kaunting DNA at ay higit pa tumpak at maaasahan kaysa kay Sanger pagkakasunud-sunod. Tingnan natin ito higit pa malapit. Para sa Sanger sequencing, isang malaking halaga ng templateDNA ang kailangan para sa bawat pagbabasa.

Sa ganitong paraan, ano ang ibig sabihin ng next generation sequencing?

Pagsunod-sunod ng susunod na henerasyon (NGS, NextGenSeq) ay isang bago pamamaraan para sa pagkakasunud-sunod genome sa mataas na bilis at sa mababang halaga. Ito ay kilala rin bilang pangalawang henerasyon na pagkakasunud-sunod (SGS) o massively parallel pagkakasunud-sunod (MPS). Gumagamit din ang mitochondrial DNA full sequence test mula sa FTDNA sunod-sunod na henerasyon teknolohiya.

Paano naiiba ang susunod na henerasyon na pagkakasunud-sunod sa tradisyonal na pagkakasunud-sunod?

Conceptually, ang pangunahing pagkakaiba sa pagitan sunod-sunod na henerasyon at iba pa tradisyonal na pagkakasunud-sunod mga pamamaraan tulad ng Sanger ang sequencing ay na susunod na henerasyonsequencing ay kayang pagkakasunod-sunod mas maraming nucleotide sa isang solong pagtakbo, isang konsepto na tinutukoy namin bilang highthroughput.

Inirerekumendang: