Bakit mas mahusay ang NGS kaysa kay Sanger?
Bakit mas mahusay ang NGS kaysa kay Sanger?

Video: Bakit mas mahusay ang NGS kaysa kay Sanger?

Video: Bakit mas mahusay ang NGS kaysa kay Sanger?
Video: Paano nilikha ang MASTERPIECES! Dimash at Sundet 2024, Nobyembre
Anonim

Laki ng sample

NGS ay makabuluhang mas mura, mas mabilis, nangangailangan ng makabuluhang mas kaunting DNA at ay higit pa tumpak at maaasahan kaysa kay Sanger pagkakasunud-sunod. Tingnan natin ito higit pa malapit. Para sa Sanger sequencing, isang malaking halaga ng templateDNA ang kailangan para sa bawat pagbabasa

Nagtatanong din ang mga tao, ano ang mga pakinabang ng susunod na henerasyon na pagkakasunud-sunod?

Ang bawat isa ay may tiyak mga pakinabang para sa pamantayan: readlength, katumpakan, oras ng pagtakbo, at throughput. Bilang karagdagan sa pagsusuri ng mga pagkakasunud-sunod ng DNA, pag-unlad ng pagkakasunud-sunod Ang mga teknolohiya ay nagresulta sa pagsusuri ng iba pang mga biological na bahagi tulad ng RNA at protina, pati na rin kung paano sila nakikipag-ugnayan sa mga kumplikadong cellular network.

Maaaring magtanong din, bakit ginagamit pa rin ang Sanger sequencing? Sanger sequencing napabuti sa paglipas ng mga taon, malaking bahagi dahil sa automation, at naging batayan para sa pagkakasunud-sunod ang unang genome ng tao noong 2000. Sa wala pang dalawang dekada, gayunpaman, nalampasan ng NGS Sanger sequencing dahil sa mataas nitong throughput, parallel operation, at mas mababang gastos sa perbase.

Alinsunod dito, ano ang pagkakaiba sa pagitan ng pagkakasunud-sunod ng Sanger at pagkakasunud-sunod ng susunod na henerasyon?

Ang bawat incorporated nucleotide ay nakikilala sa pamamagitan ng fluorescent tag nito. Ang kritikal pagkakaiba sa pagitan ng Sangersequencing at ang NGS ay pagkakasunud-sunod dami Habang ang Sanger paraan lamang mga pagkakasunod-sunod isang solong DNA fragment ata oras, NGS ay napakalaking parallel, pagkakasunud-sunod milyon-milyong mga fragment nang sabay-sabay sa bawat pagtakbo.

Gaano katumpak ang pagkakasunud-sunod ng Sanger?

Sanger sequencing na may 99.99% katumpakan ay ang "pamantayang ginto" para sa klinikal na pananaliksik pagkakasunud-sunod . Gayunpaman, nagiging karaniwan na rin ang mga bagong teknolohiya ng NGS sa mga laboratoryo ng klinikal na pananaliksik dahil sa kanilang mas mataas na kakayahan sa throughput at mas mababang gastos sa bawat sample.

Inirerekumendang: