Ano ang layunin ng paggamit ng mga ddNTP?
Ano ang layunin ng paggamit ng mga ddNTP?

Video: Ano ang layunin ng paggamit ng mga ddNTP?

Video: Ano ang layunin ng paggamit ng mga ddNTP?
Video: Aralin 2: Akademikong Sulatin (Layunin, Gamit, Katangian, Anyo) SHS Grade 11 & 12 MELCs 2024, Abril
Anonim

DdNTP tumutukoy sa Dideoxynucleotides triphosphates na ginagamit sa Sanger dideoxy method para makagawa ng iba't ibang haba ng DNA strands para sa DNA sequencing. Nagreresulta ito sa pagwawakas ng proseso ng DNA polymerization(o DNA elongation) dahil ang prosesong ito ay nangangailangan ng isang 3'-OH na grupo upang magpatuloy.

Dahil dito, bakit ginagamit ang mga ddNTP sa pagkakasunud-sunod?

Dideoxynucleotides ay mga chain-elongating inhibitors ng DNA polymerase, ginamit sa paraan ng Sanger para sa DNA pagkakasunud-sunod . Ang dideoxyribonucleotides ay walang 3' hydroxyl group, kaya't wala nang karagdagang pagpapahaba ng kadena ang maaaring mangyari kapag ang dideoxynucleotide na ito ay nasa kadena. Ito ay maaaring humantong sa pagwawakas ng DNA pagkakasunud-sunod.

Katulad nito, nakakabit ba ang mga ddNTP sa mga dNTP? Isa o higit pa sa mga mga dNTP ay radioactively na may label upang makatulong na makita ang mga produkto ng pagtitiklop. Sa wakas, ang bawat tubo ay nakakakuha ng isa sa apat na espesyal na nucleotide na tinatawag dideoxynucleotides ( mga ddNTP ). Gayunpaman, kapag naisama na, hindi na mapapalawig pa ng DNA polymerase ang chain dahil kailangan nito ng 3'-OH sa ikabit sa susunod na nucleotide.

Katulad nito, maaaring itanong ng isa, paano huminto ang mga ddNTP sa isang sequencing na reaksyon?

Kapag naroroon sa maliit na halaga sa pagkakasunud-sunod ng mga reaksyon , dideoxyribonucleoside triphosphates ( mga ddNTP ) wakasan ang sequencing reaction sa iba't ibang posisyon sa lumalaking DNA strands. Ang mga ddNTP ay humihinto sa isang sequencing reaction dahil sila ay: nagiging sanhi ng DNA polymerase na mahulog sa template strand. c.

Anong pamamaraan na kinasasangkutan ng Dideoxynucleotides ang maaaring gamitin?

Ang pagkakasunud-sunod ng Sanger ay a paraan ng DNA sequencing batay sa selective incorporation ng chain-terminating dideoxynucleotides sa pamamagitan ng DNA polymerase sa panahon ng in vitro DNA replication. Binuo ni Frederick Sanger at mga kasamahan noong 1977, ito ang pinakamalawak ginamit pagkakasunud-sunod paraan humigit-kumulang 40 taon.

Inirerekumendang: